“小金库”是指违反法律法规及其他有关规定，应列入未列入符合规定的单位账簿的各项资金（含有价证券）及其形成的资产。多年来，一直是国家严厉打击和整治的对象，也是审计查处的重点，追查行政事业单位的“小金库”主要有以下几种方法：

突击盘点

实践来看，突击盘点这种检查方法简便易行，且命中率较高，突击盘点现场必须有两名以上审计人员以及被审计单位会计出纳等同时在场，抽查时间应根据实际情况，选取早上现金收付业务尚未开始前，或晚上现金收付业务结束后，重点检查单位出纳员的金柜等，对现金、收支票据、借条等进行细致的点数、登记，然后与相关账簿进行核对，如果账实不符，不论长款、短款都可能存在“小金库”和其他违纪问题，需要进一步查证。

支出审核

审查成本费用支出时，要比较分析近年来被审计单位成本费用总额及结构变化情况，并分析变化的原因，特别要关注财务报告中成本偏高及有关费用急剧增长等异常现象，一旦发现疑点，紧抓线索，追查到底；对费用发票逐一检查，寻找可疑点，特别要注意大额支出费用和没有在账面上反映的大额会议费、培训费及福利费等支出，看是否存在虚构虚列、虚报冒领及截留隐匿资金等情况，以此来分析判断被审计单位是否存在“小金库”问题。

账户核查

在审计过程中，审计人员应当注意观察分析被审计单位的账户往来情况，重点关注资金往来频繁、金额较大的业务，并与被审计单位提供的银行开户情况自查表和银行对账单等进行核对，如果发现该单位在审计自查表以外存在账户，或者对账单反映的银行存款余额与账面不符，应进一步追查，同时还应特别注意以单位财务人员、法定代表人的名义或以奇异的代名代号的存款，如果其收支频繁，数额较大，也可能是公款私存的“小金库”。

外延审计

除对被审计单位的会计业务审计外，还要延伸对其的会议纪要、会议记录、有关合同协议等进行查看，行政事业单位的会议记录，既是领导班子成员集体决策的记载，也是分担责任、承担风险的依据，单位各项重大经济决策、福利资金的安排、其他资金的调度使用无不涉及到资金来源，对账面未做反映、而实际已经使用的资金，逆向检查这些资金的来源，要顺藤摸瓜、深挖细究。

实地调查

通过到被审计单位办公场所进行实地察看，观察办公场所有无闲置房屋租赁等情况，对房产、土地、车辆等资产的出租、出售合同、协议及收入进行调查．看是否足额入账，这些都有可能为单位带来额外收入，审计人员可以此为线索，发现单位“小金库”，对被审计单位的收入项目进行调查汇总，看收费是否全部入账，有无部分收费或乱收费流入“小金库”。

计算机筛选

随着计算机的普及，大部分单位运用计算机进行业务处理和财务核算，审计人员应当对其程序进行审核，看程序中有无将收费项目暗道流出，没有归流到财务部；运用计算机的SQL语言功能，对业务进行筛选，从中发现不正常的支出，然后重点审计，看有无虚假列支、套取现金私设“小金库”问题，有的单位用计算机核算正常业务，手工记录“小金库”收支，一明一暗“两条线核算”，审计人员不要被“全部纳入计算机核算”的假象所迷惑。